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发布时间: 2021-05-20 09:14:43
一个著名的科学家团队双重证明了一个有争议的假设。导致新冠肺炎大流行的新型冠状病毒基因片段可以整合到我们的染色体中,并在感染结束后仍然存在很长一段时间。 如果他们是正确的,那么这些插入可以解释一个罕见的发现,人们可以从新冠肺炎恢复,但他们可以在几个月后再次发现新型冠状病毒。(虽然怀疑者认为这可能只是实验室的独立产品) 干细胞生物学家鲁道夫耶尼施(Rudolf Jaenisch)和麻省理工学院基因调控专家理查德杨(Richard Young)领导了5月6日发表在《PNAS》上的新研究。 事实上,他们的团队在2020年12月的bioRxiv预印本中首次提出了这个想法,引发了推特上的竞争。研究人员强调,病毒整合并不意味着从新冠肺炎康复的人仍然具有传染性。但是批评家指责他们制造基于信使核糖核酸的新冠肺炎疫苗“平躺”没有任何理由。 LINE-1占据了人类基因组序列的17%,是古代逆转录病毒感染的遗留物。是目前人类基因组中发现的唯一具有自主转座活性的转座子。在试管中,bioRxiv的预印文章证明了新型冠状病毒基因(RNA)的DNA版本出现在感染新型冠状病毒的人类细胞的染色体上。 许多专门研究LINE-1元件和其他“反转座子”的研究人员认为支持这一说法的数据太少。 康奈尔大学的塞德里克费斯切特研究人类基因组中的内源性逆转录病毒片段。他和其他人还说,他们希望像耶尼希和杨这样的科学家能够做更高质量的工作。在随后发表在bioRxiv上的两项研究中,反对者证明,人类和病毒DNA痕迹的嵌合体可能是由研究小组用来扫描染色体的技术创造的。正如一份报告所总结的那样,人类病毒序列“更有可能是一种方法学产品,而不是真正的逆转录、整合和表达的结果。” 在他们的新论文中,Jaenisch、Young和同事承认他们使用的技术意外地制造了人类病毒嵌合体。在新的PNAS论文中,研究小组提供了人造产品本身不能解释病毒-人类嵌合DNA检测水平的证据。科学家还表明,LINE-1基因的一部分位于整合病毒基因序列的两侧,这进一步支持了他们的假设。他们还与最初的怀疑者之一——国家癌症研究所的斯蒂芬休斯合作,提出根据整合病毒序列相对于人类序列的方向,进行一项实验来阐明整合是真实的还是有噪声的。这篇新论文的合著者斯蒂芬休斯说,研究结果支持了最初的假设。“细胞培养中的综合数据比预印本中的数据更有说服力,但它仍然不是完全干净的,”费斯切特说,他现在认为耶尼希和杨的假设“可信”。(他指出,新型冠状病毒也可以在一个人身上坚持几个月而不整合其基因。) 真正的问题是细胞培养数据是否与人类健康或诊断相关。在缺乏患者整合证据的情况下,我能从这些数据中获得的最多信息是,有可能在L1过表达的受感染细胞系中检测到新型冠状病毒RNA逆转录事件。在这一点上,这些观察的临床或生物学意义(如果有的话)纯粹是推测。 杰尼斯和杨的团队还报告了新冠肺炎患者活体和死后组织中新型冠状病毒整合的迹象。特别是,研究人员发现了高水平的RNA,这种RNA只能由整合的病毒DNA在细胞读取其序列以制造蛋白质时产生。然而,杨承认,“我们还没有直接的证据。” 为什么本应该清除病毒的人有时会用阳性聚合酶链反应检测自己的序列? 弗雷德哈钦森癌症研究中心(Fred Hutchinson Cancer Research Center)人类基因组中的古病毒专家哈米特马利克(Harmit Malik)表示,在正常情况下,人类细胞中几乎没有可用的逆转录机制。 在物种的形成和进化过程中,各种活跃的转座子起着重要的作用。然而,在正常的生理条件下,这些可移动的转座因子可能会对基因组DNA的结构和功能产生不利影响。因此,一般来说,细胞对线1的转座有严格而复杂的调节机制。然而,在肿瘤形成中,LINE-1可以通过多种机制调节相关基因的表达,在肿瘤的发展中起着重要作用。近年来,作为肿瘤检测和治疗的思想,也有一些应用针对LINE-1的甲基化检测和针对其逆转录酶活性的抑制剂的开发。 如果LINE-1可以在肿瘤中主动进行转座易位,那么有潜在癌症风险的健康人对新型冠状病毒RNA(甚至新冠肺炎mRNA疫苗)的染色体整合有抵抗力吗?
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